Prebiotyki są składnikami jedzenia, mającymi dobry wpływ na florę bakteryjną jelita. Flora bakteryjna jelita to skupisko bakterii znajdujących się w przewodzie jelitowym. Bakterie te mogą być korzystne, jak bakterie wspomagające zdrowie lub bakterie chorobotwórcze, które mogą wywoływać choroby.
Prebiotyki to węglowodany, które nie są trawione przez psy lub koty. Niestrawione prebiotyki wracają do jelita gdzie oddziaływują na jego populację bakteryjną.
Niektóre prebiotyki, takie jak np. FOS (fruktooligosacharydy) pełnią rolę źródła pokarmu dla dobrych bakterii ( Lactobacillus i Bifidobakteria) i nie mogą być używane przez bakterie chorobotwórcze. Poprzez dodanie FOS do diety , stymulowany jest wzrost bakterii dobrych, podczas gdy bakterie szkodliwe są likwidowane.